Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tff2Q03404 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tff2Q03404 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tff2Q03404 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms