Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfiaQ02780 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfiaQ02780 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms