Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ascl1Q02067 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl1Q02067 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms