Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lama4P97927 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Lama4P97927 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lama4P97927 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lama4P97927 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lama4P97927 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lama4P97927 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lama4P97927 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lama4P97927 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Lama4P97927 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lama4P97927 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lama4P97927 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lama4P97927 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lama4P97927 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lama4P97927 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms