Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd3P97770 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thumpd3P97770 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thumpd3P97770 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.8 ms