Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npas2P97460 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas2P97460 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npas2P97460 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npas2P97460 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npas2P97460 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npas2P97460 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npas2P97460 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npas2P97460 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms