Protein–RNA interactions for Protein: P97315

Csrp1, Cysteine and glycine-rich protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp1P97315 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrp1P97315 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrp1P97315 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrp1P97315 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Csrp1P97315 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrp1P97315 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrp1P97315 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csrp1P97315 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms