Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim43cP86449 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim43cP86449 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim43cP86449 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim43cP86449 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim43cP86449 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim43cP86449 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim43cP86449 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms