Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps3P62908 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps3P62908 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps3P62908 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps3P62908 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps3P62908 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps3P62908 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps3P62908 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps3P62908 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps3P62908 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps3P62908 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps3P62908 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps3P62908 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms