Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,22□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,22□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,22□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,22□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,22□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13,22□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,22□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,22□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,21□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,21□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC13,21□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,21□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13,21□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,21□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,21□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,21□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,21□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,21□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13,21□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13,21□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,2□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,2□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13,2□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13,2□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,2□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,2□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13,19□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,19□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,19□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC13,19□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,19□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,19□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC13,19□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,18□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,18□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,18□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,18□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC13,18□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,18□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,18□□□□□ -0,3
Rps28P62858 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,18□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13,18□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,18□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,18□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,17□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,17□□□□□ -0,3
Rps28P62858 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13,17□□□□□ -0,3
Rps28P62858 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,17□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,17□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,17□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13,17□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,17□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC13,17□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,17□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,17□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13,16□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,16□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,16□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,16□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,16□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13,16□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,16□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,16□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13,16□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13,15□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,15□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13,15□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,15□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,15□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13,15□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,15□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,15□□□□□ -0,3
Rps28P62858 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC13,15□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13,15□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,14□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,14□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13,14□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13,14□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,14□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,14□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13,14□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,14□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,14□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,14□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,13□□□□□ -0,31
Rps28P62858 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,13□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,13□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,13□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13,13□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,13□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,13□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,13□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,13□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13,13□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,12□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,12□□□□□ -0,31
Rps28P62858 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC13,12□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13,12□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,12□□□□□ -0,31
Rps28P62858 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,12□□□□□ -0,31
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