Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lmo4P61969 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms