Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ube2kP61087 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms