Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtdsplP58465 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtdsplP58465 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtdsplP58465 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtdsplP58465 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtdsplP58465 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CtdsplP58465 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtdsplP58465 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtdsplP58465 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtdsplP58465 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtdsplP58465 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtdsplP58465 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtdsplP58465 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtdsplP58465 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtdsplP58465 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtdsplP58465 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtdsplP58465 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms