Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Exosc10P56960 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Exosc10P56960 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Exosc10P56960 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Exosc10P56960 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Exosc10P56960 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Exosc10P56960 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Exosc10P56960 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Exosc10P56960 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Exosc10P56960 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms