Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd38P56528 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd38P56528 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd38P56528 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd38P56528 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd38P56528 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd38P56528 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd38P56528 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd38P56528 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd38P56528 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cd38P56528 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms