Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacnb3P54285 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacnb3P54285 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacnb3P54285 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms