Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fgf9P54130 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fgf9P54130 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fgf9P54130 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fgf9P54130 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fgf9P54130 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fgf9P54130 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms