Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cux1P53564 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cux1P53564 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cux1P53564 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cux1P53564 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cux1P53564 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cux1P53564 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cux1P53564 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cux1P53564 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cux1P53564 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cux1P53564 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cux1P53564 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cux1P53564 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cux1P53564 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cux1P53564 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cux1P53564 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cux1P53564 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cux1P53564 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cux1P53564 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms