Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XpcP51612 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XpcP51612 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
XpcP51612 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
XpcP51612 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XpcP51612 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XpcP51612 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XpcP51612 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XpcP51612 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XpcP51612 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XpcP51612 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XpcP51612 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XpcP51612 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XpcP51612 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XpcP51612 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XpcP51612 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XpcP51612 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XpcP51612 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XpcP51612 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XpcP51612 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XpcP51612 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XpcP51612 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XpcP51612 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XpcP51612 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XpcP51612 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XpcP51612 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XpcP51612 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
XpcP51612 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XpcP51612 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XpcP51612 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XpcP51612 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XpcP51612 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XpcP51612 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XpcP51612 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XpcP51612 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XpcP51612 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XpcP51612 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XpcP51612 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XpcP51612 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
XpcP51612 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XpcP51612 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XpcP51612 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XpcP51612 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
XpcP51612 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
XpcP51612 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XpcP51612 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XpcP51612 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XpcP51612 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XpcP51612 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XpcP51612 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XpcP51612 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XpcP51612 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XpcP51612 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XpcP51612 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XpcP51612 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XpcP51612 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XpcP51612 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XpcP51612 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XpcP51612 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XpcP51612 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XpcP51612 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XpcP51612 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
XpcP51612 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
XpcP51612 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
XpcP51612 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XpcP51612 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
XpcP51612 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XpcP51612 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XpcP51612 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XpcP51612 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XpcP51612 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XpcP51612 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XpcP51612 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XpcP51612 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XpcP51612 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XpcP51612 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XpcP51612 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XpcP51612 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XpcP51612 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XpcP51612 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XpcP51612 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XpcP51612 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XpcP51612 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XpcP51612 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XpcP51612 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XpcP51612 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XpcP51612 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XpcP51612 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XpcP51612 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XpcP51612 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XpcP51612 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XpcP51612 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XpcP51612 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XpcP51612 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XpcP51612 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XpcP51612 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
XpcP51612 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XpcP51612 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XpcP51612 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XpcP51612 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms