Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PcntP48725 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PcntP48725 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PcntP48725 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PcntP48725 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PcntP48725 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PcntP48725 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PcntP48725 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PcntP48725 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PcntP48725 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PcntP48725 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PcntP48725 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PcntP48725 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PcntP48725 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PcntP48725 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PcntP48725 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PcntP48725 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PcntP48725 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PcntP48725 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PcntP48725 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PcntP48725 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PcntP48725 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PcntP48725 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PcntP48725 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PcntP48725 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PcntP48725 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PcntP48725 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PcntP48725 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PcntP48725 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PcntP48725 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PcntP48725 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PcntP48725 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PcntP48725 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PcntP48725 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PcntP48725 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PcntP48725 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PcntP48725 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PcntP48725 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PcntP48725 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PcntP48725 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PcntP48725 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PcntP48725 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PcntP48725 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PcntP48725 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PcntP48725 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PcntP48725 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PcntP48725 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PcntP48725 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PcntP48725 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PcntP48725 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PcntP48725 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PcntP48725 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PcntP48725 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PcntP48725 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PcntP48725 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PcntP48725 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PcntP48725 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PcntP48725 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PcntP48725 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PcntP48725 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PcntP48725 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PcntP48725 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PcntP48725 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PcntP48725 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PcntP48725 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PcntP48725 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PcntP48725 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PcntP48725 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PcntP48725 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PcntP48725 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PcntP48725 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PcntP48725 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PcntP48725 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PcntP48725 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PcntP48725 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PcntP48725 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PcntP48725 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PcntP48725 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PcntP48725 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PcntP48725 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PcntP48725 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PcntP48725 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PcntP48725 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PcntP48725 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PcntP48725 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PcntP48725 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PcntP48725 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PcntP48725 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PcntP48725 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PcntP48725 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PcntP48725 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PcntP48725 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PcntP48725 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PcntP48725 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PcntP48725 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PcntP48725 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PcntP48725 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PcntP48725 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PcntP48725 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PcntP48725 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms