Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx2P48379 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx2P48379 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx2P48379 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms