Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Notch4P31695 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Notch4P31695 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Notch4P31695 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Notch4P31695 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Notch4P31695 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Notch4P31695 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Notch4P31695 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Notch4P31695 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Notch4P31695 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Notch4P31695 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Notch4P31695 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Notch4P31695 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Notch4P31695 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Notch4P31695 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Notch4P31695 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Notch4P31695 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Notch4P31695 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Notch4P31695 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Notch4P31695 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Notch4P31695 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Notch4P31695 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Notch4P31695 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Notch4P31695 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Notch4P31695 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Notch4P31695 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms