Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vcam1P29533 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vcam1P29533 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vcam1P29533 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vcam1P29533 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms