Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxrbP28704 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxrbP28704 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxrbP28704 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxrbP28704 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RxrbP28704 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RxrbP28704 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RxrbP28704 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxrbP28704 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxrbP28704 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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