Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Marcksl1P28667 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Marcksl1P28667 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Marcksl1P28667 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.2 ms