Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-DMaP28078 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-DMaP28078 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms