Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd3eP22646 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eP22646 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms