Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnmt3cP0DOY1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnmt3cP0DOY1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3cP0DOY1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms