Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Surf1P09925 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Surf1P09925 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Surf1P09925 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Surf1P09925 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Surf1P09925 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Surf1P09925 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Surf1P09925 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Surf1P09925 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Surf1P09925 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Surf1P09925 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Surf1P09925 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Surf1P09925 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Surf1P09925 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Surf1P09925 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Surf1P09925 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Surf1P09925 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms