Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxb8P09632 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxb8P09632 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb8P09632 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb8P09632 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb8P09632 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms