Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06334 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06334 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06334 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P06334 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06334 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06334 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06334 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06334 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06334 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06334 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06334 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06334 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06334 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06334 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06334 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06334 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06334 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06334 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06334 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06334 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06334 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06334 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06334 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06334 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06334 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06334 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06334 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06334 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06334 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06334 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06334 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06334 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06334 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06334 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06334 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06334 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06334 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06334 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06334 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06334 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06334 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06334 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06334 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06334 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06334 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06334 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06334 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06334 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06334 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06334 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06334 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06334 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06334 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06334 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06334 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06334 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06334 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P06334 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06334 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06334 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06334 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06334 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06334 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06334 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06334 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06334 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06334 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06334 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06334 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P06334 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06334 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06334 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06334 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06334 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06334 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06334 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06334 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06334 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06334 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06334 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06334 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06334 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06334 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06334 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06334 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06334 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06334 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06334 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06334 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06334 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06334 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P06334 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06334 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06334 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06334 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06334 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06334 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06334 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06334 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms