Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifna1P01572 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifna1P01572 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna1P01572 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms