Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CopeO89079 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CopeO89079 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CopeO89079 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CopeO89079 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CopeO89079 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CopeO89079 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CopeO89079 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CopeO89079 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CopeO89079 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CopeO89079 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CopeO89079 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CopeO89079 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CopeO89079 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CopeO89079 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CopeO89079 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CopeO89079 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CopeO89079 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CopeO89079 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CopeO89079 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CopeO89079 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CopeO89079 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CopeO89079 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CopeO89079 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CopeO89079 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CopeO89079 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopeO89079 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopeO89079 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CopeO89079 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CopeO89079 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopeO89079 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopeO89079 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopeO89079 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CopeO89079 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CopeO89079 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CopeO89079 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CopeO89079 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CopeO89079 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CopeO89079 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CopeO89079 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CopeO89079 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CopeO89079 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CopeO89079 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CopeO89079 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CopeO89079 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CopeO89079 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CopeO89079 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CopeO89079 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CopeO89079 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CopeO89079 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CopeO89079 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CopeO89079 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CopeO89079 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CopeO89079 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CopeO89079 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CopeO89079 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CopeO89079 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CopeO89079 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CopeO89079 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CopeO89079 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CopeO89079 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CopeO89079 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CopeO89079 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CopeO89079 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CopeO89079 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CopeO89079 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CopeO89079 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CopeO89079 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CopeO89079 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CopeO89079 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopeO89079 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopeO89079 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopeO89079 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopeO89079 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopeO89079 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CopeO89079 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CopeO89079 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CopeO89079 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CopeO89079 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CopeO89079 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CopeO89079 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CopeO89079 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CopeO89079 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CopeO89079 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CopeO89079 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CopeO89079 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CopeO89079 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CopeO89079 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CopeO89079 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CopeO89079 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CopeO89079 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CopeO89079 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CopeO89079 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CopeO89079 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CopeO89079 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CopeO89079 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CopeO89079 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CopeO89079 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CopeO89079 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CopeO89079 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
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