Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DcxO88809 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DcxO88809 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DcxO88809 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DcxO88809 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DcxO88809 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DcxO88809 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DcxO88809 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DcxO88809 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DcxO88809 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DcxO88809 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DcxO88809 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DcxO88809 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DcxO88809 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DcxO88809 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DcxO88809 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DcxO88809 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DcxO88809 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DcxO88809 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DcxO88809 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DcxO88809 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DcxO88809 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DcxO88809 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DcxO88809 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DcxO88809 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DcxO88809 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DcxO88809 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DcxO88809 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DcxO88809 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DcxO88809 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DcxO88809 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DcxO88809 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DcxO88809 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DcxO88809 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DcxO88809 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DcxO88809 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DcxO88809 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DcxO88809 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DcxO88809 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DcxO88809 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DcxO88809 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DcxO88809 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DcxO88809 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DcxO88809 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DcxO88809 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DcxO88809 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DcxO88809 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DcxO88809 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DcxO88809 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DcxO88809 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DcxO88809 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DcxO88809 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DcxO88809 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DcxO88809 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DcxO88809 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DcxO88809 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DcxO88809 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DcxO88809 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DcxO88809 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DcxO88809 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DcxO88809 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DcxO88809 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DcxO88809 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DcxO88809 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DcxO88809 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DcxO88809 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DcxO88809 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DcxO88809 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DcxO88809 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DcxO88809 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DcxO88809 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DcxO88809 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DcxO88809 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DcxO88809 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DcxO88809 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DcxO88809 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DcxO88809 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DcxO88809 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DcxO88809 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DcxO88809 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DcxO88809 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DcxO88809 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DcxO88809 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DcxO88809 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DcxO88809 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DcxO88809 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DcxO88809 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DcxO88809 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DcxO88809 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DcxO88809 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DcxO88809 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DcxO88809 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DcxO88809 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DcxO88809 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DcxO88809 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DcxO88809 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DcxO88809 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DcxO88809 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DcxO88809 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DcxO88809 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms