Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd2O70572 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpd2O70572 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd2O70572 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms