Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtssO70370 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtssO70370 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtssO70370 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtssO70370 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtssO70370 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CtssO70370 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtssO70370 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CtssO70370 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CtssO70370 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CtssO70370 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtssO70370 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtssO70370 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtssO70370 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtssO70370 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtssO70370 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtssO70370 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtssO70370 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtssO70370 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtssO70370 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtssO70370 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtssO70370 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtssO70370 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtssO70370 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtssO70370 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtssO70370 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CtssO70370 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtssO70370 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtssO70370 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CtssO70370 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtssO70370 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtssO70370 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtssO70370 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtssO70370 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtssO70370 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtssO70370 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtssO70370 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtssO70370 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtssO70370 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtssO70370 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtssO70370 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtssO70370 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtssO70370 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtssO70370 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtssO70370 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtssO70370 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtssO70370 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtssO70370 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtssO70370 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtssO70370 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtssO70370 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtssO70370 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtssO70370 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtssO70370 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtssO70370 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtssO70370 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtssO70370 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtssO70370 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtssO70370 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtssO70370 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtssO70370 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtssO70370 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtssO70370 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtssO70370 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtssO70370 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtssO70370 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtssO70370 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtssO70370 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtssO70370 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtssO70370 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtssO70370 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtssO70370 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtssO70370 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtssO70370 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtssO70370 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtssO70370 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtssO70370 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtssO70370 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtssO70370 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CtssO70370 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CtssO70370 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtssO70370 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CtssO70370 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtssO70370 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtssO70370 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtssO70370 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtssO70370 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtssO70370 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtssO70370 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtssO70370 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtssO70370 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtssO70370 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtssO70370 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtssO70370 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CtssO70370 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtssO70370 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtssO70370 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtssO70370 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtssO70370 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtssO70370 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.9 ms