Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxq1O70220 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Foxq1O70220 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Foxq1O70220 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms