Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops5O35864 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops5O35864 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops5O35864 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cops5O35864 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cops5O35864 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops5O35864 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops5O35864 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops5O35864 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops5O35864 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cops5O35864 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops5O35864 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops5O35864 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cops5O35864 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms