Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc1O35704 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc1O35704 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc1O35704 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc1O35704 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc1O35704 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc1O35704 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc1O35704 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc1O35704 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc1O35704 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc1O35704 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc1O35704 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms