Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PnnO35691 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PnnO35691 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PnnO35691 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PnnO35691 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PnnO35691 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PnnO35691 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PnnO35691 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PnnO35691 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PnnO35691 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PnnO35691 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PnnO35691 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PnnO35691 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PnnO35691 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PnnO35691 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PnnO35691 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PnnO35691 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PnnO35691 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PnnO35691 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PnnO35691 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PnnO35691 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PnnO35691 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PnnO35691 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PnnO35691 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PnnO35691 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PnnO35691 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PnnO35691 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PnnO35691 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PnnO35691 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PnnO35691 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PnnO35691 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PnnO35691 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PnnO35691 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PnnO35691 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PnnO35691 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PnnO35691 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PnnO35691 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PnnO35691 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PnnO35691 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PnnO35691 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PnnO35691 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PnnO35691 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PnnO35691 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PnnO35691 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PnnO35691 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PnnO35691 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PnnO35691 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PnnO35691 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PnnO35691 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PnnO35691 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PnnO35691 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PnnO35691 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PnnO35691 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PnnO35691 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PnnO35691 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PnnO35691 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PnnO35691 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PnnO35691 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PnnO35691 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PnnO35691 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PnnO35691 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PnnO35691 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PnnO35691 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PnnO35691 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PnnO35691 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PnnO35691 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PnnO35691 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PnnO35691 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PnnO35691 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PnnO35691 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PnnO35691 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PnnO35691 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PnnO35691 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PnnO35691 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PnnO35691 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PnnO35691 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PnnO35691 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PnnO35691 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PnnO35691 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PnnO35691 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PnnO35691 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PnnO35691 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PnnO35691 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PnnO35691 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PnnO35691 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PnnO35691 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PnnO35691 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PnnO35691 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PnnO35691 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PnnO35691 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PnnO35691 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PnnO35691 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PnnO35691 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PnnO35691 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PnnO35691 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PnnO35691 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PnnO35691 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PnnO35691 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PnnO35691 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PnnO35691 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms