Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn6O35454 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clcn6O35454 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcn6O35454 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcn6O35454 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms