Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hs3st1O35310 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hs3st1O35310 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hs3st1O35310 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hs3st1O35310 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hs3st1O35310 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hs3st1O35310 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hs3st1O35310 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hs3st1O35310 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hs3st1O35310 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms