Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ascl4M0QW46 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl4M0QW46 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms