Protein–RNA interactions for Protein: J3QPR6

Rfpl4b, MCG1377, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfpl4bJ3QPR6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rfpl4bJ3QPR6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfpl4bJ3QPR6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfpl4bJ3QPR6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfpl4bJ3QPR6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfpl4bJ3QPR6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfpl4bJ3QPR6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfpl4bJ3QPR6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfpl4bJ3QPR6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfpl4bJ3QPR6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfpl4bJ3QPR6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfpl4bJ3QPR6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfpl4bJ3QPR6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfpl4bJ3QPR6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfpl4bJ3QPR6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfpl4bJ3QPR6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfpl4bJ3QPR6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfpl4bJ3QPR6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms