Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sclt1G5E861 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sclt1G5E861 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms