Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pcf11G3X9Z4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Pcf11G3X9Z4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pcf11G3X9Z4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms