Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm29094F6Q785 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm29094F6Q785 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm29094F6Q785 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm29094F6Q785 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm29094F6Q785 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm29094F6Q785 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Gm29094F6Q785 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gm29094F6Q785 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm29094F6Q785 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm29094F6Q785 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms