Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf165E9QAU8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Rnf165E9QAU8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Rnf165E9QAU8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Rnf165E9QAU8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf165E9QAU8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Rnf165E9QAU8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Rnf165E9QAU8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Rnf165E9QAU8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Rnf165E9QAU8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Rnf165E9QAU8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf165E9QAU8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
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