Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp17lbE9Q9U0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp17lbE9Q9U0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp17lbE9Q9U0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp17lbE9Q9U0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
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