Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TrdnE9Q9K5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TrdnE9Q9K5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TrdnE9Q9K5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms